廠房設置了抵押，我認為是還是可以賣的。從權屬上來說，抵押并不是讓渡房產的所有權，既然抵押人還擁有房產的所有權，自然應該有處置的權利。

但是，因為設置了抵押，因此抵押人處置抵押物的時候，不能損害抵押權人的利益。換句話說，你賣廠房的錢必須用來歸還銀行借款。

對于購買者來說，當然也需要獲得廠房的權屬證明，就是將產權過戶。在過戶產權的時候，因為有抵押設定在先，在未解除抵押之前是辦不了過戶手續的。我不相信有這樣的傻瓜，沒有查清房產權屬狀況就把錢付清了。——所以，只要沒解除抵押，是賣不了廠房的。

所以題主的這種擔心是不存在的，除非真的遇到了傻子，否則已抵押的廠房是賣不出去的。